महर्षि संस्थान ने आयुर्वेद व योग चिकित्सा के लिये एक उच्च श्रेणी का 50 शैयाओं वाले चिकित्सालय की स्थापना की है। इसी चिकित्सा के साथ महर्षि स्वास्थ्य विज्ञान संस्थान भी प्रारम्भ किया गया है। यह संस्थान परा चिकित्सकीय पाठ्‌यक्रम, वैद्यों, पंचकर्म तकनीशियन, स्वास्थ्य परिचारिका व सहायक, स्पा तकनीशियन व योग प्रशिक्षणकों का प्रशिक्षण करेगा, जिनकी अत्याधिक कमी है।